本帖最后由 Vicky_Sugar 于 2024-6-7 17:48 编辑
波函数分析新手求助!
如下图1是经过关键词#opt freq m062x/6-31+g(d,p) scrf=(smd,solvent=water)优化得到的分子的部分结构。此前我推测该结构中O36和C6各带一个自由基,但是按照sob老师http://sobereva.com/82博文中的方法进行计算后发现该结构的原子自旋布居都接近于0,且波函数是稳定的,故认定该结构是闭壳层结构,不存在自由基,所以接下来分别用Mayer键级、ELF函数、Mulliken布居分析进行波函数挖掘,但是由于知识的薄弱,对得到的信息无法进行充分的解读,所以想请各位老师指点迷津!主要的疑问在于不知道如何画这个分子的结构式,以及对这个结构的化学键和电子分布情况的模糊认知导致无法分析下一步化学反应的方向。
图2是此部分结构的Mayer键级计算结果,计算所用的fchk文件由关键词# m062x/6-31g(d,p) scrf=(smd,solvent=water)计算单点能得到;
图3是由36O、35O和6C平面绘制的ELF二维填色图;
图4是由37O、1C和2C平面绘制的ELF二维填色图;
下面是Mulliken布居分析的部分结果,如果需要我可以上传完整结果(计算所用的fchk文件也是由关键词# m062x/6-31g(d,p) scrf=(smd,solvent=water)计算单点能得到)。
Atom 1(C ) s: 3.1617 p: 2.4999 d: 0.0516 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 2(C ) s: 3.2328 p: 2.9209 d: 0.0039 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 3(C ) s: 3.2359 p: 2.8806 d: 0.0063 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 4(C ) s: 3.2439 p: 2.8671 d: 0.0068 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 5(C ) s: 3.1988 p: 2.9321 d: 0.0039 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 6(C ) s: 3.1528 p: 2.3815 d: 0.0526 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 35(O ) s: 3.8739 p: 4.2823 d: 0.0467 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 36(O ) s: 3.9809 p: 4.5598 d: 0.0062 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 37(O ) s: 3.9198 p: 4.6014 d: 0.0033 f: 0.0000 g: 0.0000 h: 0.0000
Atom 1(C ) Population: 5.71315880 Net charge: 0.28684120
Atom 2(C ) Population: 6.15755741 Net charge: -0.15755741
Atom 3(C ) Population: 6.12279924 Net charge: -0.12279924
Atom 4(C ) Population: 6.11773502 Net charge: -0.11773502
Atom 5(C ) Population: 6.13470172 Net charge: -0.13470172
Atom 6(C ) Population: 5.58688166 Net charge: 0.41311834
Atom 35(O ) Population: 8.20287086 Net charge: -0.20287086
Atom 36(O ) Population: 8.54687944 Net charge: -0.54687944
Atom 37(O ) Population: 8.52451473 Net charge: -0.52451473
补充一下O35和O36附近价层电子密度图(图5)
202406021551504992..jpg
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图4
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图2
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图1
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图3
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图5